MatrixFrame beschikt over een rapportsysteem waarmee de inhoud van de rapporten via instellingen kan worden geregeld. Er kunnen verschillende rapport configuraties worden samengesteld, die naar eigen inzicht kunnen worden opgeslagen, gewijzigd of verwijderd.
MatrixFrame versie 6.0 beschikt over een nieuw en gemoderniseerd rapportsysteem. In de uitleg op de volgende pagina's wordt daarom onderscheid gemaakt tussen instellingen voor het rapportsysteem van versie 5.5 en eerder en het nieuwe systeem vanaf versie 6.0.